Наразі однією з основних функцій Деснянського БУВР є захист від шкідливої дії води та підтоплення населених пунктів і сільськогосподарських угідь.
Значна роль у стійкому нарощуванні продовольчого фонду регіону та одержанні високих і стійких врожаїв сільськогосподарських культур є забезпечення безаварійного пропуску весняного водопілля на меліоративній мережі.
Цьогоріч це питання неабияк актуальне у зв’язку з проходженням високих рівнів повеневих вод, особливо на річці Десна, що супроводжуються виходом води на заплаву, підтопленням населених пунктів і сільськогосподарських угідь.
З метою захисту від підтоплення повеневими водами річки Десна присадибних ділянок населення громад с. Кладьківка, с. Патюти Чернігівського району та с. Воловиця Ніжинського району Деснянським БУВР було запущено в роботу агрегати насосних станцій о/с «Млинок» та о/с «Калита-Гало».
Станом на сьогодні, за період роботи насосних станцій з підтоплених території відведено близько 1,5 млн м3 води.
