Моніторингові дослідження якісного стану вод річок Десна, Снов, Стрижень, Сейм, Клевень, Вздвиж та Убідь, проводиться за пріоритетними забруднюючими органічними і неорганічними речовинами, в місцях питних водозаборів додатково за фізико-хімічними показниками.
- Вода в річці Десна за якісними показниками має добрий стан. Показники азотної групи та фосфатів в межах норми. В зв’язку з сезонними коливання температурного режиму інколи спостерігається підвищений вміст показників органічного забруднення.
- На Деснянському водозаборі питної води, з якого здійснюється централізоване водопостачання міста Києва, при щомісячному контролі якості основні фізико-хімічні показники стабільні з незначними коливаннями в межах норми.
- Якість водних ресурсів річок басейну Десни характеризується підвищеним вмістом заліза та марганцю, який має природне походження.
- На річках суббасейну Десни, які досліджуються, мають місце поодинокі факти наявності показників-забруднювачів з групи поліароматичних вуглеводнів, пестицидів, летких органічних сполук та важких металів згідно екологічних нормативів якості.
- В 2024 році річки Сейм та Десна зазнали екологічної катастрофи через військові дії. У результаті забруднення річок зафіксована масова загибель риби внаслідок критично низького вмісту розчиненого у воді кисню.
- Факти органічного забруднення стану вод річок Сейм та Десна супроводжувались перевищенням ГДК по хімічному споживанню кисню, азоту амонійному, марганцю та залізу загальному.
- Річка Снов на Чернігівщині вважається транскордонною і за пріоритетними забруднюючими органічними та неорганічними показниками відповідає екологічним нормам якості.
- Найбільших змін якісного стану поверхневих вод від точкового та дифузного забруднення зазнає річка Стрижень.
- До основних забруднювачів річки Стрижень належать речовини азотної групи, фосфати та різноманітні органічні сполуки. Внаслідок антропогенного навантаження проходження самостійних біологічних процесів очищення вод відсутнє.