Відповідно до Положення Дежводагентства Деснянське басейнове управління водних ресурсів є бюджетною організацією, що належить до сфери управління центрального органу виконавчої влади у галузі розвитку водного господарства і меліорації земель, управління, використання та відтворення поверхневих водних ресурсів – Державного агентства водних ресурсів України.

Основними завданнями Деснянського БУВР є:

• забезпечення реалізації державної політики у сфері управління, використання та відтворення поверхневих водних ресурсів басейну р. Дніпро у межах Чернігівської області та басейну р. Десна;
• забезпечення реалізації державної політики у сфері розвитку водного господарства тагідротехнічної меліорації земель у межах Чернігівській області;
• спрямування та координація діяльності організацій, що належать до сфери управління Держводагентства, з питань управління, використання та відтворення поверхневих водних ресурсів у межах басейну р. Десна.